Nastava u gimnaziji „Ruđer Bošković” se ostvaruje po nastavnom planu i programu za gimnazije opšteg smera, propisanim od strane Ministarstva prosvete Republike Srbije.
Redovna nastava se ostvaruje kroz razredno-časovni sistem, organizovanjem celodnevne nastave (čas redovne nastave traje 45 minuta); dodatni rad sa učenicima obuhvata realizaciju aktivnosti koje su usklađene sa nastavnim sadržajima, predznanjima i postignućima učenika i njihovim posebnim interesovanjima.
Rad sa učenicima van redovne nastave ostvaruje se svakodnevno prema utvrđenom rasporedu. Ciljevi rada sa učenicima van redovne nastave su:
-brži napredak učenika sa nižim nivoom predznanja
-lakše savladavanje osnovnih zahteva nastavnih programa,
-podsticanje razvoja posebnih interesovanja učenika,
-podsticanje razvoja posebnih sposobnosti učenika.
Pored obaveznih i obaveznih izbornih predmeta, učenici mogu da učestvuju u kreativnim aktivnostima škole – KAŠ.